MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Mexico chromosome

Total Repeats: 108463

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016804	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769744
2	NC_016804	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769744
3	NC_016804	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
4	NC_016804	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
5	NC_016804	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769744
6	NC_016804	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
7	NC_016804	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
8	NC_016804	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
9	NC_016804	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	378769744
10	NC_016804	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
11	NC_016804	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
12	NC_016804	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
13	NC_016804	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769744
14	NC_016804	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	378769744
15	NC_016804	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
16	NC_016804	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	378769744
17	NC_016804	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	378769744
18	NC_016804	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	378769744
19	NC_016804	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769744
20	NC_016804	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
21	NC_016804	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769744
22	NC_016804	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769744
23	NC_016804	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	378769744
24	NC_016804	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	378769744
25	NC_016804	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
26	NC_016804	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769744
27	NC_016804	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
28	NC_016804	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769744
29	NC_016804	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	378769744
30	NC_016804	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769744
31	NC_016804	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769744
32	NC_016804	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	378769744
33	NC_016804	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769744
34	NC_016804	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016804	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016804	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016804	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016804	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016804	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016804	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016804	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016804	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016804	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016804	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016804	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016804	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016804	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016804	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	378769745
49	NC_016804	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	378769745
50	NC_016804	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	378769745
51	NC_016804	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378769745
52	NC_016804	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769745
53	NC_016804	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769745
54	NC_016804	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769745
55	NC_016804	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769745
56	NC_016804	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769745
57	NC_016804	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378769745
58	NC_016804	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	378769745
59	NC_016804	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769745
60	NC_016804	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769745
61	NC_016804	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769745
62	NC_016804	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769745
63	NC_016804	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769745
64	NC_016804	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769745
65	NC_016804	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	378769745
66	NC_016804	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769745
67	NC_016804	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378769745
68	NC_016804	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	378769745
69	NC_016804	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769745
70	NC_016804	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	378769745
71	NC_016804	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769745
72	NC_016804	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769745
73	NC_016804	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	378769745
74	NC_016804	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	378769745
75	NC_016804	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769745
76	NC_016804	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	378769745
77	NC_016804	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	378769746
78	NC_016804	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769746
79	NC_016804	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
80	NC_016804	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	378769746
81	NC_016804	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
82	NC_016804	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
83	NC_016804	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769746
84	NC_016804	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769746
85	NC_016804	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769746
86	NC_016804	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	378769746
87	NC_016804	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
88	NC_016804	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378769746
89	NC_016804	GTG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
90	NC_016804	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	378769746
91	NC_016804	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
92	NC_016804	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	378769746
93	NC_016804	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769746
94	NC_016804	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
95	NC_016804	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
96	NC_016804	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
97	NC_016804	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
98	NC_016804	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
99	NC_016804	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
100	NC_016804	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769746
101	NC_016804	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769746
102	NC_016804	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769746
103	NC_016804	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769746
104	NC_016804	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769746
105	NC_016804	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769746
106	NC_016804	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769747
107	NC_016804	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	378769747
108	NC_016804	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	378769747
109	NC_016804	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769747
110	NC_016804	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769747
111	NC_016804	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769747
112	NC_016804	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769747
113	NC_016804	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769747
114	NC_016804	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769747
115	NC_016804	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	378769747
116	NC_016804	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016804	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769748
118	NC_016804	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
119	NC_016804	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769748
120	NC_016804	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378769748
121	NC_016804	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769748
122	NC_016804	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
123	NC_016804	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
124	NC_016804	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769748
125	NC_016804	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
126	NC_016804	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	378769748
127	NC_016804	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	378769748
128	NC_016804	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
129	NC_016804	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769748
130	NC_016804	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
131	NC_016804	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378769748
132	NC_016804	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
133	NC_016804	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	378769748
134	NC_016804	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378769748
135	NC_016804	ACGGT	2	10	5747	5756	20 %	20 %	40 %	20 %	378769748
136	NC_016804	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	378769748
137	NC_016804	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769748
138	NC_016804	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
139	NC_016804	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769748
140	NC_016804	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
141	NC_016804	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
142	NC_016804	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769748
143	NC_016804	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	378769748
144	NC_016804	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378769748
145	NC_016804	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378769748
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147	NC_016804	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769748
148	NC_016804	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	378769748
149	NC_016804	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769748
150	NC_016804	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	378769748
151	NC_016804	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378769748
152	NC_016804	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
153	NC_016804	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769748
154	NC_016804	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378769748
155	NC_016804	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769748
156	NC_016804	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378769748
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158	NC_016804	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378769748
159	NC_016804	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378769748
160	NC_016804	GT	3	6	7131	7136	0 %	50 %	50 %	0 %	378769748
161	NC_016804	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769748
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167	NC_016804	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769749
168	NC_016804	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378769749
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172	NC_016804	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	378769749
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234	NC_016804	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_016804	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
236	NC_016804	CGC	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378769750
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257	NC_016804	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_016804	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_016804	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_016804	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_016804	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_016804	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_016804	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
264	NC_016804	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_016804	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_016804	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
267	NC_016804	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_016804	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_016804	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
270	NC_016804	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_016804	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_016804	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_016804	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_016804	GAC	2	6	11863	11868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_016804	GGC	2	6	12108	12113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378769751
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287	NC_016804	GCC	2	6	12315	12320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_016804	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_016804	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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302	NC_016804	CCCG	2	8	13446	13453	0 %	0 %	25 %	75 %	378769753
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307	NC_016804	CGG	2	6	13701	13706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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